Phenotypic and genotypic characterization of oxacillin-susceptible and mecA positive Staphylococcus aureus strains isolated in Uruguay / Caracterización fenotípica y genotípica de cepas de Staphylococcus aureus sensibles a oxacilina y mecA positivas aisladas en Uruguay

Abstract The aim of this study was to characterize phenotypically and genotypically 27 mecApositive Staphylococcus aureus strains with oxacillin MICs of ≤2 g/ml by Vitek 2, isolated indifferent regions of Uruguay. Susceptibility to oxacillin and cefoxitin was studied by gradient dif-fusion, disk diffusion to cefoxitin, and Phoenix and MicroScan systems. PBP2a was determined.SCCmec typing was performed and the isolates were compared by PFGE. Twenty-six isolateswere susceptible to oxacillin; one strain was susceptible to cefoxitin by disk diffusion and 3strains by gradient diffusion. Phoenix and MicroScan panels detected methicillin resistance in25 and 27 strains, respectively. Twenty-six strains tested positive for PBP2a. Twenty-six strainscarried SCCmec V and 24 belonged to pulsotype A. One strain carried SCCmec IV and did notbelong to pulsotype A. Cefoxitin disk diffusion test and PBP2a detection correctly identified 26of these 27 strains as MRSA. PFGE results suggest the dissemination of a cluster of MRSA carryingSCCmec V.

Resumen El objetivo de este estudio fue caracterizar fenotípicamente y genotípicamente 27 cepas de Staphylococcus aureus positivas para mecA y con CIM de oxacilina <2 pg/ml según Vitek 2, obtenidas en diferentes regiones del país. La sensibilidad frente a la oxacilina y la cefoxitina se estudió por difusión en gradiente, por disco-difusión (cefoxitina) y por los sistemas Phoenix y MicroScan. Se analizó la portación de PBP2a, se realizó la tipificación de SCCmec y las cepas se compararon mediante PFGE. Resultaron sensibles a oxacilina por difusión en gradiente 26 cepas; una fue sensible a cefoxitina por disco-difusión y 3 lo fueron por difusión en gradiente. Los sistemas Phoenix y MicroScan detectaron resistencia a meticilina en 25 y 27 cepas, respectivamente. Asimismo, 26 cepas portaban PBP2a y 26 cepas mostraron presencia de SCCmec V, 24 correspondieron al pulsotipo A. Una portaba SCCmec IV y no perteneció al pulsotipo A. La prueba de disco-difusión con cefoxitina y la detección de PBP2a identificaron 26 de 27 cepas como MRSA. La PFGE sugiere la diseminación de un grupo MRSA con SCCmec V. © 2022 Asociación Argentina de Microbiología. Publicado por Elsevier Espana, S.L.U. Este es un artículo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Utilidad del panel FilmArray® BCID en la detección de bacteriemia: estudio multicéntrico latinoamericano / Usefulness of the FilmArray® BCID panel in the detection of bacteremia: Latin American multicenter study

Resumen Los objetivos de este estudio fueron determinar el desempeño del panel BCID de FilmArray® y establecer el impacto de estos resultados en el tratamiento antimicrobiano de pacientes con bacteriemia en 11 hospitales de Latinoamérica. Se incluyeron 397 episodios de bacteriemia y se documentaron 551 microorganismos aislados de hemocultivos. La identificación microbiana fue correcta en el 91,4% (504/551) de los aislados y en el 98,6% (504/511) si se consideran solo los microorganismos incluidos en el panel BCID. La sensibilidad en la detección de los genes mecA, vanA/B y blaKPC fue del 100% y la especificidad fue del 97%, 100% y 99,6% respectivamente. La notificación temprana del resultado permitió cambios terapéuticos en 242 episodios (60,9%). El panel BCID es un método confiable y rápido para la detección de mecanismos críticos de resistencia y de los microorganismos más frecuentemente aislados de bacteriemias y permite la optimización temprana del tratamiento antimicrobiano.

Abstract The objectives of this study were to determine the performance of the BCID panel and to establish the impact of these results on the antimicrobial treatment of patients with bacteremia in 11 hospitals in Latin America. Three hundred and ninety-seven episodes of bacteremia were included and 551 microorganisms isolated from blood cultures were documented. Microbial identification was correct in 91.4% (504/551) of the isolates and in 98.6% (504/511) if only the microorganisms included in the BCID panel are considered. The sensitivity in the detection of the genes mecA, vanA/B and blaKPC was 100% and the specificity was 97%, 100% and 99.6% respectively. Early notification of the outcome allowed therapeutic changes in 242 episodes (60.9%). The BCID panel is a reliable and rapid method for the detection of critical resistance mechanisms and of the microorganisms most frequently isolated from bacteremia and it enables early optimisation of antimicrobial treatment.

Resumo Os objetivos deste estudo foram determinar o desempenho do painel BCID do FilmArray® e estabelecer o impacto desses resultados no tratamento antimicrobiano de pacientes com bacteremia em 11 hospitais da América Latina. Trezentos e noventa e sete episódios de bacteremia foram incluídos e 551 microrganismos isolados de hemoculturas foram documentados. A identificação microbiana foi correta em 91,4% (504/551) dos isolados e em 98,6% (504/511) considerando apenas os microrganismos incluídos no painel BCID. A sensibilidade na detecção dos genes mecA, vanA/B e blaKPC foi de 100% e a especificidade foi de 97%, 100% e 99,6% respectivamente. A notificação precoce do desfecho permitiu mudanças terapêuticas em 242 episódios (60,9%). O painel BCID é um método confiável e rápido para a detecção de mecanismos críticos de resistência e dos microrganismos mais frequentemente isolados da bacteremia e permite a otimização precoce do tratamento antimicrobiano.

Incidencia de sepsis precoz por Streptococcus agalactiae en recién nacidos del Centro Hospitalario Pereira Rossell en el período 2007-2015 / Incidence of group B streptococcal early-onset sepsis in infants born at Centro Hospitalario Pereira Rossell between 2007-2015

Resumen Introducción La infección por Streptococcus agalactiae (β-hemolítico del grupo B (SGB) continúa siendo una de las principales causas de sepsis precoz en países desarrollados a pesar de la implementación de profilaxis efectiva. Objetivos Describir la incidencia, características clínicas y mortalidad de sepsis precoz por SGB en recién nacidos del Centro Hospitalario Pereira Rossell (CHPR), y analizar las fallas de adherencia a las estrategias de prevención. Métodos Estudio retrospectivo de descripción de casos entre los años 2007 a 2015 identificados a partir de la base de datos del laboratorio de bacteriología. Resultados Se identificaron 15 casos de sepsis neonatal precoz a SGB con una incidencia en el período de estudio de 0,23‰. La quimioprofilaxis intraparto no fue realizada en caso alguno. Todos los recién nacidos se presentaron sintomáticos en las primeras 15 h de vida. La dificultad respiratoria fue el signo más frecuente (80%). En un caso se aisló SGB de líquido cefalorraquídeo. La mortalidad fue de 20%. Todas las muertes ocurrieron en las primeras 24 h de vida, siendo dos tercios prematuros. Conclusión La incidencia de sepsis precoz por SGB en el CHPR fue similar a la incidencia en centros donde se realiza quimioprofilaxis. Una mejor adherencia a las estrategias de prevención podría disminuir la incidencia.

Background: Group B Streptococcus (GBS) disease remains the leading cause of early-onset sepsis (EOS) in developed countries despite effective prophylaxis strategies. Aims: To describe the incidence, clinical features and mortality of GBS EOS in infants born at Centro Hospitalario Pereira Rossell (CHPR) and analyse failure of adherence to prevention strategies. Methods: Retrospective review of EOS cases between 2007 and 2015 collected from the bacteriology laboratory database. Results: Fifteen cases of GBS EOS were identified, with an incidence of 0.23% during the study period. Intrapartum antibiotic prophylaxis (IAP) was not administered in any of the cases. All infants were symptomatic within the first 15 hours of life, mainly due to respiratory signs (80%). In one case, GBS was isolated from spinal fluid. Mortality rate was 20%. All deaths occurred in the first 24 hours of life, corresponding two thirds to preterm infants. Conclusion: The incidence of GBS EOS at CHPR was similar to other centers where IAP is implemented. Better adherence to prophylaxis strategies could reduce the incidence.

Prevalence and serotype distribution of Listeria monocytogenes isolated from foods in Montevideo-Uruguay

ABSTRACT The aim of this work was to study the prevalence of Listeria monocytogenes in foods obtained in retail shops and food industries located in Montevideo-Uruguay, and to identify the serogroups of the obtained isolates. Three-thousand one-hundred and seventy-five food samples (frozen, deli meats, ready-to-eat and cheese) were analyzed. The obtained isolates were serogrouped by multiplex PCR and serotyped by conventional procedure. Genetic comparisons were performed using pulsed-field gel electrophoresis on a sub-set of isolates belonging to the same serotype successively recovered from the same establishment. L. monocytogenes was isolated from 11.2% of samples. The highest prevalence was observed in frozen foods (38%), followed by cheese (10%). 1/2b and 4b were the most frequently identified serotypes. In six of 236 analyzed establishments we successively recovered L. monocytogenes isolates belonging to the same serotype. Most of them corresponded to serotype 1/2b. Pulsed-field gel electrophoresis profiles suggest that at least 33% of L. monocytogenes 1/2b isolates are genetically related and that may remain viable for prolonged periods. The observed prevalence of L. monocytogenes was lower than reported in neighboring countries. Our findings highlight the role that frozen foods may play in the spread of this pathogen, and the relevance of serotypes 1/2b and 4b.

Desarrollo y ensayo de dos procedimientos para la detección rápida de Streptococcus agalactiae en exudados vaginorrectales / Development and testing of two procedures for the quick detection of Streptococcus agalactiae in rectal-vaginal exudates

Introducción: la infección por Estreptococo grupo B (EGB) puede afectar gravemente a la madre y al feto durante la gestación y al recién nacido luego del parto. Actualmente, eldiagnóstico de colonización durante el embarazo se realiza por métodos microbiológicos a partir de exudados vaginorrectales. Objetivo: desarrollar métodos rápidos y de bajo costo para la detección del antígeno grupo específico de EGB en exudados vaginorrectales.Material y método: se utilizaron dos cepas de EGB, una autóctona (IH23) y la cepa de referencia O90R, que solo expresa el polisacárido específico de grupo. Para cada una se preparó un antisuero policlonal que se utilizó para el desarrollo de un test inmunocromatográfico y uno de aglutinación de látex. Como controles se emplearon cultivos bacterianos, polisacáridos purificados de EGB y muestras vaginorrectales. Resultados: los límites de detección obtenidos para la inmunocromatografía fueron de 210 μg/ml y 50 μg/ml para los polisacáridos purificados de sobrenadante y pared, respectivamente, no lográndose detectar antígenos de EGB en las muestras clínicas analizadas. El límite dedetección del látex fue 65 μg/ml frente al polisacárido purificado de sobrenadante de cultivo de IH23 y 6,5 x 107 UFC/ml de IH23. La sensibilidad y especificidad para el látex fue de 30% y90%, respectivamente. Conclusiones: los métodos desarrollados no alcanzaron el límite de detección requerido parasu aplicación en muestras clínicas. Esto concuerda con lo descripto en la bibliografía para ensayos rápidos basados en reacciones antígeno-anticuerpo y muestra la necesidad deagregar pasos previos de extracción y concentración o mejorar la calidad de los reactivos inmunológicos empleados.

Introduction: group B streptococcal infection (GBS) may seriously affect mother and fetuses during pregnancy, and the newborn after delivery. Today, diagnosis of colonization during pregnancy is done by means of microbiological methods of vaginal and rectal exudates. Objective: to develop fast and low cost methods to detect the GBS specific group antigen in vaginal-rectal exudates. Method: we used two EGB strains, one of the (IH23)autochthonous and the reference strain O90R, that only expresses the group specific polysaccharide. We prepareda polyclonal antiserum for each one of them which was used to conduct an immunochromatographic test and alatex agglutination test. We used bacterial culture, EGB purified polysaccharides and vagina,-rectal samples as control. Results: detection limits obtained for the immunochromatographic test were 210 μg/ml and 50 μg/ml for purifiedpolysaccharides and cell wall, respectively, there being no EGB antigens detected in the clinical samples analyzed. Latex detection limit was 65 μg/ml compared to purified polysaccharides of IH23 culture supernatant and 6,5 x 107 UFC/ml of IH23. Sensitivity and specificity for latex was 30% and 90% respectively.Conclusions: the methods used failed to reach the detection limit required for its application in our clinical samples. This agrees with what is described in bibliography about quick tests based on antigen-antibody reactions and indicated the need to add previous extractionand concentration steps or to improve the quality of the immunologic reagents used.

Introdução: a infecção por Estreptococo grupo B (EGB) pode afetar gravemente a mãe e o feto durante a gravidez e o recém nascido imediatamente depois do parto. Atualmente, o diagnóstico de colonização durante a gestação é feita por métodos microbiológicos empregando exsudados vaginorretais.Objetivo: desenvolver métodos rápidos de baixo custo para a detecção do antígeno grupo específico de EGB emexsudados vaginorretais. Material e método: foram utilizadas duas cepas deEGB, uma autóctone (IH23) e a cepa de referência O90R, que expressa somente o polissacarídeo específico do grupo.Para cada uma foi preparado um antisoro policlonal utilizado para o desenvolvimento de um teste imunocromatográfico e um de aglutinação de látex. Foram empregadoscultivos bacterianos, polissacarídeos purificados de EGB e amostras vaginorretais como controles. Resultados: os limites de detecção obtidos para a imunocromatografia foram de 210 μg/ml e 50 μg/ml para ospolissacarídeos purificados de sobrenadante e parede, respectivamente, no sendo possível detectar antígenos de EGB nas amostras clínicas analisadas. O limite dedetecção do látex foi 65 μg/ml quando comparado com o polissacarídeo purificado de sobrenadante de cultivo deIH23 y 6,5 x 107 UFC/ml de IH23. A sensibilidade e especificidade para o látex foi de 30% y 90%, respectivamente. Conclusões: os métodos desenvolvidos não alcançaramo limite de detecção requerido para sua aplicação em amostras clínicas. Estes resultados são similares aos dadosdescritos na bibliografia para ensaios rápidos baseados em reações antígeno-anticorpo e mostram a necessidade de agregar passos prévios de extração econcentração ou melhorar a qualidade dos reativos imunológicos utilizados.